近期,我院服装设计智能化重点实验室杨博副教授撰写的题为《Deep structure integrative representation of multi-omics data for cancer subtyping》学术论文在《Bioinformatics》(https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac345)(中科院数学与计算生物学领域1区,Top,CCF推荐B类)期刊上发表。
该论文针对生物多组学数据的集成问题,提出了一种深层表示学习网络框架。该框架通过同时捕获稀疏子空间中的全局几何结构与流形子空间中的局部几何结构,建立病人样本间的相似关系,并利用聚类策略实现癌症亚型的预测。该方法有助于提升癌症预后预测效果,推进精准医疗的研究与应用。本研究成果得到了国家自然科学基金项目(编号:61806159)和bat365官网科研计划项目(编号:BS202108)的联合支持。(撰稿:杨博 审核:张凯兵)
杨博个人简介:
杨博,男,博士,副教授。长期从事机器学习、数据挖掘、生物信息学等方面的研究工作,先后主持国家自然科学基金青年项目、中国博士后科学基金面上项目(一等资助)、西安市科技计划项目、陕西省教育厅重点项目等。以第一作者身份在《Bioinformatics》、《IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics》、《Pattern Recognition》等国际期刊发表,目前承担IEEE TCYB、TNNLS、TCBB、Bioinformatics等期刊的审稿工作。